Sequence Space

释义 Definition（中文）

序列空间：指在某一规则下（如长度固定、字母表固定：A/C/G/T 或 20 种氨基酸），所有可能的序列所构成的“抽象空间”。在生物信息学与进化生物学中，常用来描述基因、蛋白质序列如何通过突变在可能性集合中“移动”，以及不同序列与功能/适应度之间的关系。（在其他领域也可泛指“序列的可能性空间”，但最常见用法在分子生物学与进化研究。）

发音 Pronunciation（IPA）

/ˈsiːkwəns speɪs/

例句 Examples

Mutations move a gene through sequence space.
突变会让一个基因在序列空间中移动。

By mapping fitness across sequence space, researchers can identify which variants are more likely to evolve and persist.
通过在序列空间中绘制适应度分布，研究者可以找出哪些变体更可能进化并持续存在。

词源 Etymology（中文）

sequence 来自拉丁语 sequi（“跟随”），引申为“按顺序排列的事物”；space 表示“空间/范围”。组合成 sequence space，就是“序列所占据的可能性空间/范围”，强调“所有可行序列的集合”这一概念，而非真实的物理空间。

相关词 Related Words

• Alphabet
• Amino Acid
• Bioinformatics
• Fitness Landscape
• Genotype
• Mutation
• Protein
• Variant

文学与经典出处 Literary Works

• John Maynard Smith，“Natural selection and the concept of a protein space”（Nature, 1970）——提出并推广“（蛋白）序列空间/蛋白空间”的经典讨论。
• Stuart A. Kauffman，《The Origins of Order》（1993）——在复杂系统与进化框架下频繁讨论序列空间与适应度景观。
• **Richard Durbin et al.**，《Biological Sequence Analysis》（1998）——在序列分析与概率模型语境中涉及“序列空间”的表述与相关思想。
• Andreas Wagner，《Robustness and Evolvability in Living Systems》（2005）——讨论基因型网络、鲁棒性与在序列空间中的可进化性。